dbPAF Protein Information
Tag | Content | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
dbPAF ID | dbPAF-0052401 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Uniprot Accession | G5E870; TRIPC_MOUSE; Q3TY88; Q3UYT5; Q8BM59; Q8K051; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genbank Protein ID | NP_598736.4; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genbank Nucleotide ID | NM_133975.4; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | E3 ubiquitin-protein ligase TRIP12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Synonyms/Alias | Thyroid receptor-interacting protein 12;TR-interacting protein 12;TRIP-12; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | Trip12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Synonyms/Alias | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism | Mus musculus(Mouse) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NCBI Taxa ID | 10090 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Functional Description (View all) |
E3 ubiquitin-protein ligase involved in ubiquitin fusion degradation (UFD) pathway and regulation of DNA repair. Part of the ubiquitin fusion degradation (UFD) pathway, a process that mediates ubiquitination of protein at their N-terminus, regardeless of the presence of lysine residues in target proteins. In normal cells, mediates ubiquitination and degradation of isoform p19ARF/ARF of CDKN2A, a lysine-less tumor suppressor required for p53/TP53 activation under oncogenic stress. In cancer cells, however, isoform p19ARF/ARF and TRIP12 are located in different cell compartments, preventing isoform p19ARF/ARF ubiquitination and degradation. Does not mediate ubiquitination of isoform p16-INK4a of CDKN2A. Also catalyzes ubiquitination of NAE1 and SMARCE1, leading to their degradation. Ubiquitination and degradation of target proteins is regulated by interaction with proteins such as MYC, TRADD or SMARCC1, which disrupt the interaction between TRIP12 and target proteins. Acts as a key regulator of DNA damage response by acting as a suppressor of RNF168, an E3 ubiquitin-protein ligase that promotes accumulation of 'Lys-63'-linked histone H2A and H2AX at DNA damage sites, thereby acting as a guard against excessive spreading of ubiquitinated chromatin at damaged chromosomes (By similarity). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phosphorylation Sites |
dbPAF PTMs: 53 (View all)
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence (Fasta) | MSNRPNNNPG GSLRRSQRNT AGAQPQDDSI GGRSCSSSSA VIVPQPEDPD RANTSERQKT 60 GQVPKKDNSR GVKRSASPDY NRTNSPSSAK KPRAFQHIES FSETNKPHSK SKKRHLDQEQ 120 QLKSAQLPST SKAHTRKSVA AGSSRNQKRK RTESSCVKSG SGSESTGAEE RSAKPIKLAS 180 KSATSAKAGC STITDSSSAA STSSSSSAIA SASSTVPAGA RVKQGKDQNK ARRSRSASSP 240 SPRRSSREKE QSKTGGSSKF DWAARFSPKV SLPKTKLSLP GSSKSETSKP GPSGLQAKLA 300 SLRKSTKKRS ESPPAELPSL RRSTRQKTTG SCASTSRRGS GLGKRGAAEA RRQEKMADPE 360 SNQETVNSSA ARTDEAPQGA AASSSVAGAV GMTTSGESES DDSEMGRLQA LLEARGLPPH 420 LFGPLGPRMS QLFHRTIGSG ASSKAQQLLQ GLQASDESQQ LQAVIEMCQL LVMGNEETLG 480 GFPVKSVVPA LITLLQMEHN FDIMNHACRA LTYMMEALPR SSAVVVDAIP VFLEKLQVIQ 540 CIDVAEQALT ALEMLSRRHS KAILQAGGLA DCLLYLEFFS INAQRNALAI AANCCQSITP 600 DEFHFVADSL PLLTQRLTHQ DKKSVESTCL CFARLVDNFQ HEENLLQQVA SKDLLTNVQQ 660 LLVVTPPILS SGMFIMVVRM FSLMCSNCPT LAVQLMKQNI AETLHFLLCG ASNGSCQEQI 720 DLVPRSPQEL YELTSLICEL MPCLPKEGIF AVDTMLKKGN AQNTDGAIWQ WRDDRGLWHP 780 YNRIDSRIIE AAHQVGEDEI SLSTLGRVYT IDFNSMQQIN EDTGTARAIQ RKPNPLANSN 840 TSGYSELKKD DARAQLMKED PELAKSFIKT LFGVLYEVYS SSAGPAVRHK CLRAILRIIY 900 FADAELLKDV LKNHAVSSHI ASMLSSQDLK IVVGALQMAE ILMQKLPDIF SVYFRREGVM 960 HQVKHLAESE SLLTSPPKAC TNGSGSLGST TPASSGTATA ATNASADLGS PSLQHSRDDS 1020 LDLSPQGRLS DVLKRKRLPK RGPRRPKYSP PRDDDKVDNQ AKSPTTTQSP KSSFLASLNP 1080 KTWGRLSAQS NSNNIEPART AGVSGLARAA SKDTISNNRE KIKGWIKEQA HKFVERYFSS 1140 ENMDGSNPAL NVLQRLCAAT EQLNLQVDGG AECLVEIRSI VSESDVSSFE IQHSGFVKQL 1200 LLYLTSKNEK DAVGREIRLK RFLHVFFSSP LPGEEPVGRV EPVGHAPLLA LVHKMNNCLS 1260 QMEQFPVKVH DFPSGNGAGG SFSLNRGSQA LKFFNTHQLK CQLQRHPDCA NVKQWKGGPV 1320 KIDPLALVQA IERYLVVRGY GRVREDDEDS DDDGSDEEID ESLAAQFLNS GNVRHRLQFY 1380 IGEHLLPYNM TVYQAVRQFS VQAEDEREST DDESNPLGRA GIWTKTHTIW YKPVREDEES 1440 TKDCVGGKRG RAQTAPTKTS PRNAKKHDEL WHDGVCPSVA NPLEVYLIPT PPENITFEDP 1500 SLDVILLLRV LHAISRYWYY LYDNAMCKEI IPTSEFINSK LTAKANRQLQ DPLVIMTGNI 1560 PTWLTELGKT CPFFFPFDTR QMLFYVTAFD RDRAMQRLLD TNPEINQSDS QDSRVAPRLD 1620 RKKRTVNREE LLKQAESVMQ DLGSSRAMLE IQYENEVGTG LGPTLEFYAL VSQELQRADL 1680 CLWRGEEVTL SNPKGSQEGT KYIQNLQGLF ALPFGRTAKP AHIAKVKMKF RFLGKLMAKA 1740 IMDFRLVDLP LGLPFYKWML RQETSLTSHD LFDIDPVVAR SVYHLEDIVR QKKRLEQDKS 1800 QTKESLQYAL ETLTMNGCSV EDLGLDFTLP GFPNIELKKG GKDIPVTIHN LEEYLRLVIF 1860 WALNEGVCRQ FDSFRDGFES VFPLCHLQYF YPEELDQLLC GSKADTWDAK TLMECCRPDH 1920 GYTHDSRAVK FLFEILSSFD NEQQRLFLQF VTGSPRLPVG GFRSLNPPLT IVRKTFESTE 1980 NPDDFLPSVM TCVNYLKLPD YSSIDIMRDK LLIAAREGQQ SFHLS 2026 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Keyword | KW-0007--Acetylation |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interpro | IPR011989--ARM-like |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PROSITE | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pfam | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | GO:0005737--C:cytoplasm |