dbPAF Protein Information
Tag | Content | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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dbPAF ID | dbPAF-0050893 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Uniprot Accession | E9Q5F9; SETD2_MOUSE; Q69ZC0; Q6PCY9; Q8K0F3; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genbank Protein ID | NP_001074809.2; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genbank Nucleotide ID | NM_001081340.2; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | Histone-lysine N-methyltransferase SETD2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Synonyms/Alias | Lysine N-methyltransferase 3A;SET domain-containing protein 2; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | Setd2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Synonyms/Alias | Kiaa1732;Kmt3a; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism | Mus musculus(Mouse) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NCBI Taxa ID | 10090 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Functional Description (View all) |
Histone methyltransferase that specifically trimethylates 'Lys-36' of histone H3 (H3K36me3) using dimethylated 'Lys-36' (H3K36me2) as substrate. Represents the main enzyme generating H3K36me3, a specific tag for epigenetic transcriptional activation. Plays a role in chromatin structure modulation during elongation by coordinating recruitment of the FACT complex and by interacting with hyperphosphorylated POLR2A. Acts as a key regulator of DNA mismatch repair in G1 and early S phase by generating H3K36me3, a mark required to recruit MSH6 subunit of the MutS alpha complex: early recruitment of the MutS alpha complex to chromatin to be replicated allows a quick identification of mismatch DNA to initiate the mismatch repair reaction. H3K36me3 also plays an essential role in the maintenance of a heterochromatic state, by recruiting DNA methyltransferase DNMT3A. H3K36me3 is also enhanced in intron-containing genes, suggesting that SETD2 recruitment is enhanced by splicing and that splicing is coupled to recruitment of elongating RNA polymerase. Required during angiogenesis. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phosphorylation Sites |
dbPAF PTMs: 68 (View all)
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Sequence (Fasta) | MKPLPSQQPP PKMGDFYDPE HPTPEEEENE AKIENVQKTG FIKGPVFKGV ASSRFLPKGT 60 KTKVNLEEQG RQKVSFSFSF TKKTLQNRFL TALSNEKQSD SPNSPAPPLQ VDSNPKVKMD 120 AGDTFPATEE SSPPKSRVEL GRIHFKKHLL HVTSRPQLAA STTAASPLPP TTQLPAVLAE 180 SMIDSPPSSP PPPPPPPQAS SPSPPAQISE PVALPQPPAT ALMTSPPGPL PGDVAVRAQK 240 ESPVKSGPEV LEVDTKQDIV SNSLEEHTVQ TLKEQADHLL QKEDSHIGKE EEVSDGSKIS 300 LSSKKASSKK KSSQFEGTFL GSESDEDSVR TSSSQRSHDL KSSTSIDKER DFKKSSAPSK 360 SEDLGKSSRS KTERDDRYCS YSKLERDTRY VSSRCRSERD RRRSRSRSRS DRASRTSLSY 420 SRSERSHYYD SERRYHRSSP YRERTRYSRP YTDNRARESS DSEDEYKKTY PRRTSAHSYR 480 DLRTSSSYSK FDRDCKTETS YLEMERRGKY TSKLERESKR TSEHETIKRC CSPPNELGFR 540 RGSSYSKHDN STSRYKSALS KSISKNDKFK NSFCCTELNE ENKQSHSFSL QTPCSKGSEL 600 RTINKISERE KTGSPTPSNQ LNDSPTFKKL DESPVLKPEF IGHDGRESIK ELELSKVKND 660 QLRNFCSIEL NVNGSPETEA DVATFCTSKT DAISMTSDDS VTGSEVSPLI KACMLSSNGF 720 QNVGRCRERD SDDTCRQHNT SKSPFREMEP LLSPHHDKLM SLPVKTIDYP KTLIKEPVDK 780 RHSCCKTKDS DIYCSPNENP EAENAEPSAM TISSHSFVNV HLESKTVICD NREPTDRHSE 840 NTCDEYKQSI GSTSSASHNH FDGLYEPIGS SGISSLQSPP SGIRCEENTS PTLDAVESKK 900 GIDFLKYARK ETDVGSALPD SGKGFSWENR HNNVLSGQSL QEAQEEGNSI LHERRGRPEI 960 PLDEEQRGHT HISDDSEVVF PYDLNLTMED SDGITYTLKC DSSGNAPEIV STVHEDYSGS 1020 SASSSDESDS EDTESDDSSI PRNRLQSVVV VPKNSTLPME ETSPCSSRSS QSYKHYSDRW 1080 EDGLETRRHA YEEEYESKGC SQTEKYFLHK GTERSAESCY SQFGRKADNH LPDIAHAQSD 1140 GVDSTSQTDS RSDHLGHLNP EDTLRAKTSR PQELPVYSDD FEDLPNKSRQ QMIFSNRPDS 1200 SRLGKTELSF SSSCDISRMD GLHSSEELRN LGWDFSQQER PTTTYQQPDS SYGTCGTHKY 1260 QQSTEHYGGT HNYWQGNGYW DPRSAGRPPG TGLAYDRIQG QVPDSLTDDR EEEEHWDQRS 1320 GSHFSSPSNK FFFHQKDKGS VQAPEISSNS IKDALVMNER KDFSKNFEKN DIKERGPPKK 1380 RRQELESDSE SDGELQARKK VRVEMEQGES SVPQHSELMG PSCAMDDFRD PQRWKEFAKL 1440 GKMPCYFDLI EENVYLTERK KNKSHRDIKR MQCECTPLSK DERAQGEVAC GEDCLNRLLM 1500 IECSSRCPNG DYCSNRRFQR KQHADVEVIL TEKKGWGLRA AKDLPSNTFV LEYCGEVLDH 1560 KEFKARVKEY ARNKNIHYYF MALKNDEIID ATQKGNCSRF MNHSCEPNCE TQKWTVNGQL 1620 RVGFFTTKLV PSGSELTFDY QFQRYGKEAQ KCFCGSANCR GYLGGENRVS IRAAGGKMKK 1680 ERSRKKDSVD GELEALMENG EGLSDKNQVL SLSRLMVRIE TLEQKLTCLK LIQNTHSQSC 1740 LKSFLERHGL SLLWIWMAEL GDGRESNQKL QEEIIKTLEH LPIPTKNMLE ESKVLPIIQR 1800 WSQTKTAVPQ LSEGDGYSSE NTSRAHTPLN TPDPSAKPST EMDTDTPKKL IFRRLKIISE 1860 NSMDSAVSDV TSELECKDGK EDLDQLETVT VEEDEELQSQ QLLPQQLCES KVESEATIEV 1920 SKLPTSEPEA DTETEPKDSN GTKLEETIAE ETPSQDEEEG VSDVESERSQ EPPDKTVDIS 1980 DLATKLLDSW KDLKEVYRIP KKSQTEKEST VAERGRDAAA FRDQTAPKTP NRSRERDPDK 2040 QSQNKEKRKR RGSLSPPSSA YERGTKRPDD RYDTPTSKKK VRIKDRNKLS TEERRKLFEQ 2100 EVAQREAQKQ QQQMQNLGMT SPLPFDSLGY NASHHPFAGY PPGYPMQAYV DPSNPNAGKV 2160 LLPTPSMDPV CSPAPYDHAQ PLVGHSTESL AAPPSVPVVP HVAASVEVSS SQYVAQNESV 2220 VHQDSNVPVM PVQAPGPVQG QNYNVWESNQ QSVSVQQQYS PAQSQTTIYY QGQTCSTVYS 2280 VTSPYSQTTP PIVQSYAQPS LQYIQGQQIF TAHPQGVVVQ PTAAVTSIVA PGQPQSLQPP 2340 EMVVTNNLLD LPPPSPPKPK TIVLPPNWKT ARDPEGKIYY YHVITRQTQW DPPTWESPGD 2400 DASLEHEAEM DLGTPTYDEN PMKTSKKPKT AEADTSSELA KKSKEVFRKE MSQFIVQCLN 2460 PYRKPDCKVG RITTTEDFKH LARKLTHGVM NKELKYCKNP EDLECNENVK HKTKEYIKKY 2520 MQKFGAVYKP KEDTELE 2538 |
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Keyword | KW-0010--Activator |
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Interpro | IPR006560--AWS_dom |
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PROSITE | PS51215--AWS |
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Pfam | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | GO:0005694--C:chromosome |