dbPAF Protein Information
Tag | Content | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
dbPAF ID | dbPAF-0016725 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Uniprot Accession | Q12532; RQC2_YEAST; D6W403; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genbank Protein ID | NP_015316.1; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genbank Nucleotide ID | NM_001183823.1; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | Ribosome quality control complex subunit 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Synonyms/Alias | Translation-associated element 2; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | RQC2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Synonyms/Alias | TAE2;YPL009C;YP8132.04C; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism | Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)(Baker's yeast) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NCBI Taxa ID | 559292 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Functional Description (View all) |
Component of the ribosome quality control complex (RQC), a ribosome-associated complex that mediates ubiquitination and extraction of incompletely synthesized nascent chains for proteasomal degradation (PubMed:23178123). RQC2 is responsible for selective recognition of stalled 60S subunits by recognizing an exposed, nascent chain-conjugated tRNA moiety (PubMed:25349383). RQC2 is important for the stable association of RKR1/LTN1 to the complex (PubMed:23479637). RQC2 recruits alanine- and threonine-charged tRNA to the A site and directs the elongation of stalled nascent chains independently of mRNA or 40S subunits, leading to non-templated C-terminal Ala and Thr extensions (CAT tails). CAT tails induce a HSF1-dependent heat shock response (PubMed:25554787). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phosphorylation Sites |
dbPAF PTMs: 12
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence (Fasta) | MKQRISALDL LLLARELKQD LEGYRLSNIY NIADSSKQFL LKFNKPDSKL NVVVDCGLRI 60 YLTEFSRPIP PTPSGFVVKL RKHLKAKRLT ALKQVDQDRI LVLQFADGHF YLVLEFFSAG 120 NVILLDENRR IMALQRVVLE HENKVGQIYE MFDESLFTTN NESADESIEK NRKAEYTSEL 180 VNEWIKAVQA KYESDITVIK QLNIQGKEGA KKKKVKVPSI HKLLLSKVPH LSSDLLSKNL 240 KVFNIDPSES CLNLLEETDS LAELLNSTQL EYNQLLTTTD RKGYILAKRN ENYISEKDTA 300 DLEFIYDTFH PFKPYINGGD TDSSCIIEVE GPYNRTLDKF FSTIESSKYA LRIQNQESQA 360 QKKIDDARAE NDRKIQALLD VQELNERKGH LIIENAPLIE EVKLAVQGLI DQQMDWNTIE 420 KLIKSEQKKG NRIAQLLNLP LNLKQNKISV KLDLSSKELN TSSDEDNESE GNTTDSSSDS 480 DSEDMESSKE RSTKSMKRKS NEKINVTIDL GLSAYANATE YFNIKKTSAQ KQKKVEKNVG 540 KAMKNIEVKI DQQLKKKLKD SHSVLKKIRT PYFFEKYSWF ISSEGFLVMM GKSPAETDQI 600 YSKYIEDDDI YMSNSFNSHV WIKNPEKTEV PPNTLMQAGI LCMSSSEAWS KKISSSPWWC 660 FAKNVSKFDG SDNSILPEGA FRLKNENDQN HLPPAQLVMG FGFLWKVKTS GNEDNGDDDE 720 EEEEEEEEEE EEEEEEEEEE EEEKEEEEKE EEQQQDEDDS NEVNGLEKGG DSNDSTKNNS 780 FEHDNLEKDI EKHCTISSDT DSDSGNAKAK NDNSSTQRIL DEPGVPISLI ENINSNVRGK 840 RGKLKKIQKK YADQDETERL LRLEALGTLK GIEKQQQRKK EEIMKREVRE DRKNKREKQR 900 RLQALKFTKK EKARVNYDKH KSELKPSLDK GDVVDDIIPV FAPWPALLKY KYKVKIQPGS 960 AKKTKTLTEI LHYFKSRPLD GSSTDNEMDW PQEHEMIKGL KEQDLVLLLC VDKLKVTIAG 1020 QKSTKNGGNS SKKGKKKR 1039 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Keyword | KW-0175--Coiled coil |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interpro | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PROSITE | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pfam | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | GO:0010494--C:cytoplasmic stress granule |