dbPAF Protein Information
Tag | Content | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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dbPAF ID | dbPAF-0016596 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Uniprot Accession | Q12297; TAF3_YEAST; D6W401; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genbank Protein ID | NP_015314.1; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genbank Nucleotide ID | NM_001183825.1; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | Transcription initiation factor TFIID subunit 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Synonyms/Alias | TAFII-47;TAFII47;TBP-associated factor 3;TBP-associated factor 47 kDa; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | TAF3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Synonyms/Alias | TAF47;YPL011C;LPA6C; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism | Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)(Baker's yeast) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NCBI Taxa ID | 559292 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Functional Description (View all) |
Functions as a component of the DNA-binding general transcription factor complex TFIID. Binding of TFIID to a promoter (with or without TATA element) is the initial step in pre-initiation complex (PIC) formation. TFIID plays a key role in the regulation of gene expression by RNA polymerase II through different activities such as transcription activator interaction, core promoter recognition and selectivity, TFIIA and TFIIB interaction, chromatin modification (histone acetylation by TAF1), facilitation of DNA opening and initiation of transcription. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phosphorylation Sites |
dbPAF PTMs: 9
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Sequence (Fasta) | MTTNNDFYFA LLRISILQLL KAQGFDRARP SLVDVMTDLY AKFLSLLASE VSSIAQARCD 60 QDDTIALQDI TLALENLGIV KPTNVLDVYD ENSELSSSRG MEKFKDWCIY STQLTDARIT 120 ALPTVELLQS EEKESDPLSA IPDYLNQLLQ NKGAKQKLET KNRKTELIED LINNNGLDDW 180 IKLVIARQRI NMIERASKKE SQNVPALPHI AGYKSSILSR HHHTTITNED RMPSAMTPRD 240 EDALTEIQEN PFVTSKLPIM RKENRLENIT LSFEDEELES LGEVEGPNQK SQENNNEESF 300 KENNKSLTES PHGDDRDISM FQFDSNVDTK WAEQEDMDST FQRRTSLDYG GYF 354 |
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Keyword | KW-0175--Coiled coil |
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Interpro | IPR006565--BTP |
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PROSITE | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pfam | PF07524--Bromo_TP |
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Gene Ontology | GO:0005669--C:transcription factor TFIID complex |