dbPAF Protein Information
Tag | Content | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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dbPAF ID | dbPAF-0003043 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Uniprot Accession | O88453; SAFB1_RAT; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genbank Protein ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genbank Nucleotide ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | Scaffold attachment factor B1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Synonyms/Alias | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | Safb | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Synonyms/Alias | Safb1; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism | Rattus norvegicus(Rat) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NCBI Taxa ID | 10116 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Functional Description (View all) |
Binds to scaffold/matrix attachment region (S/MAR) DNA and forms a molecular assembly point to allow the formation of a 'transcriptosomal' complex (consisting of SR proteins and RNA polymerase II) coupling transcription and RNA processing. When associated with RBMX, binds to and stimulates transcription from the SREBF1 promoter (By similarity). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phosphorylation Sites |
dbPAF PTMs: 10
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Sequence (Fasta) | MAETLSGLGD SGAASAAAVS SAASETGTRR LSDLRVIDLR AELRKRNLTS SGNKSVLMER 60 LKKAIEEEGG NPDEIEVISE GNKKMPKRPS KGKKPEDEGV EDNGLEENSG DGQEDVETSL 120 ENLQDMDMMD ISVLDEADID NGSVADCVEE EEEATLPEGL GLLRIGRLQS KGLPEQLQEL 180 AIDDKEAINN VDTSSSDFTI LQEMEEASLE PENEKILDIL GETCKSEPVK EEGSELEQPF 240 AQATSSVGPD RKLAEEEDLF ESCGHPEEEE EEEEEEEQEE EQEEEGDLAL ASSSKSESSS 300 TRCQWSEADA LLAVVKREPA EAPGGGTGMD REPVGLEEPV EQSSTAAQLP ETTSQELVRA 360 PTAAPSPEPR DSKDDVKKFA FDACNDVPAA PKESSASEGA DQKMSSVEDD SDTKRLSREE 420 KGRSSCGRNF WVSGLSSTTR ATDLKNLFSR YGKVVGAKVV TNARSPGARC YGFVTMSTAE 480 EATKCINHLH KTELHGKMIS VEKAKSEPAG KRVPDRRDGD SKKEKTSTSD RSANLKREEK 540 GDRKDDAKKT DDGSTEKSKD ADDQKPGPSE RSRTTKSGSR GTERTVVMDK SKGVPVISVK 600 TSGSKERASK SQDRKSVSRE KRSVVSFDKV KESRKSRDSE SRRERERERS EREQRLQAQW 660 EREERERLEI ARERLAFHRH RLERERMERE RLERERMHVE QERRREQERI HREREELRRQ 720 QELRYEQERR PAVRRPYEVD GRRDDAYWPE AKRAALDDRY HSDFSRQDRF HDFDHRDRGR 780 YPNHSVDRRE GSRSMMGDRE GQHYPERHGG PERHGRDSRD GWGYGSNKRL SEGRGLPLLP 840 RRDWGEHARR LEDDRAWQGT ADGGMMERDQ QRWQGGERSM SGHSGPGHMM NRGGMSGRGS 900 FAPGGASRRH VIPRGGMQAG FGGTEPGQQT Q 932 |
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Keyword | KW-0007--Acetylation |
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Interpro | IPR012677--Nucleotide-bd_a/b_plait |
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PROSITE | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pfam | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | GO:0005634--C:nucleus |