dbPAF Protein Information
Tag | Content | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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dbPAF ID | dbPAF-0001455 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Uniprot Accession | O43151; TET3_HUMAN; A6NEI3; Q86Z24; Q8TBM9; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genbank Protein ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genbank Nucleotide ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | Methylcytosine dioxygenase TET3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Synonyms/Alias | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | TET3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Synonyms/Alias | KIAA0401; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism | Homo sapiens(Human) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NCBI Taxa ID | 9606 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Functional Description (View all) |
Dioxygenase that catalyzes the conversion of the modified genomic base 5-methylcytosine (5mC) into 5-hydroxymethylcytosine (5hmC) and plays a key role in epigenetic chromatin reprogramming in the zygote following fertilization. Also mediates subsequent conversion of 5hmC into 5-formylcytosine (5fC), and conversion of 5fC to 5-carboxylcytosine (5caC). Conversion of 5mC into 5hmC, 5fC and 5caC probably constitutes the first step in cytosine demethylation. In zygotes, DNA demethylation occurs selectively in the paternal pronucleus before the first cell division, while the adjacent maternal pronucleus and certain paternally-imprinted loci are protected from this process. Participates in DNA demethylation in the paternal pronucleus by mediating conversion of 5mC into 5hmC, 5fC and 5caC. Does not mediate DNA demethylation of maternal pronucleus because of the presence of DPPA3/PGC7 on maternal chromatin that prevents TET3-binding to chromatin (By similarity). In addition to its role in DNA demethylation, also involved in the recruitment of the O-GlcNAc transferase OGT to CpG-rich transcription start sites of active genes, thereby promoting histone H2B GlcNAcylation by OGT. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phosphorylation Sites |
dbPAF PTMs: 28 (View all)
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Sequence (Fasta) | MDSGPVYHGD SRQLSASGVP VNGAREPAGP SLLGTGGPWR VDQKPDWEAA PGPAHTARLE 60 DAHDLVAFSA VAEAVSSYGA LSTRLYETFN REMSREAGNN SRGPRPGPEG CSAGSEDLDT 120 LQTALALARH GMKPPNCNCD GPECPDYLEW LEGKIKSVVM EGGEERPRLP GPLPPGEAGL 180 PAPSTRPLLS SEVPQISPQE GLPLSQSALS IAKEKNISLQ TAIAIEALTQ LSSALPQPSH 240 STPQASCPLP EALSPPAPFR SPQSYLRAPS WPVVPPEEHS SFAPDSSAFP PATPRTEFPE 300 AWGTDTPPAT PRSSWPMPRP SPDPMAELEQ LLGSASDYIQ SVFKRPEALP TKPKVKVEAP 360 SSSPAPAPSP VLQREAPTPS SEPDTHQKAQ TALQQHLHHK RSLFLEQVHD TSFPAPSEPS 420 APGWWPPPSS PVPRLPDRPP KEKKKKLPTP AGGPVGTEKA APGIKPSVRK PIQIKKSRPR 480 EAQPLFPPVR QIVLEGLRSP ASQEVQAHPP APLPASQGSA VPLPPEPSLA LFAPSPSRDS 540 LLPPTQEMRS PSPMTALQPG STGPLPPADD KLEELIRQFE AEFGDSFGLP GPPSVPIQDP 600 ENQQTCLPAP ESPFATRSPK QIKIESSGAV TVLSTTCFHS EEGGQEATPT KAENPLTPTL 660 SGFLESPLKY LDTPTKSLLD TPAKRAQAEF PTCDCVEQIV EKDEGPYYTH LGSGPTVASI 720 RELMEERYGE KGKAIRIEKV IYTGKEGKSS RGCPIAKWVI RRHTLEEKLL CLVRHRAGHH 780 CQNAVIVILI LAWEGIPRSL GDTLYQELTD TLRKYGNPTS RRCGLNDDRT CACQGKDPNT 840 CGASFSFGCS WSMYFNGCKY ARSKTPRKFR LAGDNPKEEE VLRKSFQDLA TEVAPLYKRL 900 APQAYQNQVT NEEIAIDCRL GLKEGRPFAG VTACMDFCAH AHKDQHNLYN GCTVVCTLTK 960 EDNRCVGKIP EDEQLHVLPL YKMANTDEFG SEENQNAKVG SGAIQVLTAF PREVRRLPEP 1020 AKSCRQRQLE ARKAAAEKKK IQKEKLSTPE KIKQEALELA GITSDPGLSL KGGLSQQGLK 1080 PSLKVEPQNH FSSFKYSGNA VVESYSVLGN CRPSDPYSMN SVYSYHSYYA QPSLTSVNGF 1140 HSKYALPSFS YYGFPSSNPV FPSQFLGPGA WGHSGSSGSF EKKPDLHALH NSLSPAYGGA 1200 EFAELPSQAV PTDAHHPTPH HQQPAYPGPK EYLLPKAPLL HSVSRDPSPF AQSSNCYNRS 1260 IKQEPVDPLT QAEPVPRDAG KMGKTPLSEV SQNGGPSHLW GQYSGGPSMS PKRTNGVGGS 1320 WGVFSSGESP AIVPDKLSSF GASCLAPSHF TDGQWGLFPG EGQQAASHSG GRLRGKPWSP 1380 CKFGNSTSAL AGPSLTEKPW ALGAGDFNSA LKGSPGFQDK LWNPMKGEEG RIPAAGASQL 1440 DRAWQSFGLP LGSSEKLFGA LKSEEKLWDP FSLEEGPAEE PPSKGAVKEE KGGGGAEEEE 1500 EELWSDSEHN FLDENIGGVA VAPAHGSILI ECARRELHAT TPLKKPNRCH PTRISLVFYQ 1560 HKNLNQPNHG LALWEAKMKQ LAERARARQE EAARLGLGQQ EAKLYGKKRK WGGTVVAEPQ 1620 QKEKKGVVPT RQALAVPTDS AVTVSSYAYT KVTGPYSRWI 1661 |
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Keyword | KW-0025--Alternative splicing |
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Interpro | IPR024779--2OGFeDO_nucleic_acid_mod |
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PROSITE | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pfam | PF12851--Tet_JBP |
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Gene Ontology | GO:0005737--C:cytoplasm |