dbPAF Protein Information
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dbPAF ID | dbPAF-0000709 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Uniprot Accession | O14646; CHD1_HUMAN; Q17RZ3; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genbank Protein ID | NP_001261.2; XP_005271924.1; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genbank Nucleotide ID | NM_001270.2; XM_005271867.3; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Synonyms/Alias | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | CHD1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Synonyms/Alias | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism | Homo sapiens(Human) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NCBI Taxa ID | 9606 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Functional Description (View all) |
ATP-dependent chromatin-remodeling factor which functions as substrate recognition component of the transcription regulatory histone acetylation (HAT) complex SAGA. Regulates polymerase II transcription. Also required for efficient transcription by RNA polymerase I, and more specifically the polymerase I transcription termination step. Regulates negatively DNA replication. Not only involved in transcription-related chromatin-remodeling, but also required to maintain a specific chromatin configuration across the genome. Is also associated with histone deacetylase (HDAC) activity (By similarity). Required for the bridging of SNF2, the FACT complex, the PAF complex as well as the U2 snRNP complex to H3K4me3. Functions to modulate the efficiency of pre-mRNA splicing in part through physical bridging of spliceosomal components to H3K4me3. Required for maintaining open chromatin and pluripotency in embryonic stem cells. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phosphorylation Sites |
dbPAF PTMs: 94 (View all)
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Sequence (Fasta) | MNGHSDEESV RNSSGESSQS DDDSGSASGS GSGSSSGSSS DGSSSQSGSS DSDSGSESGS 60 QSESESDTSR ENKVQAKPPK VDGAEFWKSS PSILAVQRSA ILKKQQQQQQ QQQHQASSNS 120 GSEEDSSSSE DSDDSSSEVK RKKHKDEDWQ MSGSGSPSQS GSDSESEEER EKSSCDETES 180 DYEPKNKVKS RKPQNRSKSK NGKKILGQKK RQIDSSEEDD DEEDYDNDKR SSRRQATVNV 240 SYKEDEEMKT DSDDLLEVCG EDVPQPEEEE FETIERFMDC RIGRKGATGA TTTIYAVEAD 300 GDPNAGFEKN KEPGEIQYLI KWKGWSHIHN TWETEETLKQ QNVRGMKKLD NYKKKDQETK 360 RWLKNASPED VEYYNCQQEL TDDLHKQYQI VERIIAHSNQ KSAAGYPDYY CKWQGLPYSE 420 CSWEDGALIS KKFQACIDEY FSRNQSKTTP FKDCKVLKQR PRFVALKKQP SYIGGHEGLE 480 LRDYQLNGLN WLAHSWCKGN SCILADEMGL GKTIQTISFL NYLFHEHQLY GPFLLVVPLS 540 TLTSWQREIQ TWASQMNAVV YLGDINSRNM IRTHEWTHHQ TKRLKFNILL TTYEILLKDK 600 AFLGGLNWAF IGVDEAHRLK NDDSLLYKTL IDFKSNHRLL ITGTPLQNSL KELWSLLHFI 660 MPEKFSSWED FEEEHGKGRE YGYASLHKEL EPFLLRRVKK DVEKSLPAKV EQILRMEMSA 720 LQKQYYKWIL TRNYKALSKG SKGSTSGFLN IMMELKKCCN HCYLIKPPDN NEFYNKQEAL 780 QHLIRSSGKL ILLDKLLIRL RERGNRVLIF SQMVRMLDIL AEYLKYRQFP FQRLDGSIKG 840 ELRKQALDHF NAEGSEDFCF LLSTRAGGLG INLASADTVV IFDSDWNPQN DLQAQARAHR 900 IGQKKQVNIY RLVTKGSVEE DILERAKKKM VLDHLVIQRM DTTGKTVLHT GSAPSSSTPF 960 NKEELSAILK FGAEELFKEP EGEEQEPQEM DIDEILKRAE THENEPGPLT VGDELLSQFK 1020 VANFSNMDED DIELEPERNS KNWEEIIPED QRRRLEEEER QKELEEIYML PRMRNCAKQI 1080 SFNGSEGRRS RSRRYSGSDS DSISEGKRPK KRGRPRTIPR ENIKGFSDAE IRRFIKSYKK 1140 FGGPLERLDA IARDAELVDK SETDLRRLGE LVHNGCIKAL KDSSSGTERT GGRLGKVKGP 1200 TFRISGVQVN AKLVISHEEE LIPLHKSIPS DPEERKQYTI PCHTKAAHFD IDWGKEDDSN 1260 LLIGIYEYGY GSWEMIKMDP DLSLTHKILP DDPDKKPQAK QLQTRADYLI KLLSRDLAKK 1320 EALSGAGSSK RRKARAKKNK AMKSIKVKEE IKSDSSPLPS EKSDEDDDKL SESKSDGRER 1380 SKKSSVSDAP VHITASGEPV PISEESEELD QKTFSICKER MRPVKAALKQ LDRPEKGLSE 1440 REQLEHTRQC LIKIGDHITE CLKEYTNPEQ IKQWRKNLWI FVSKFTEFDA RKLHKLYKHA 1500 IKKRQESQQN SDQNSNLNPH VIRNPDVERL KENTNHDDSS RDSYSSDRHL TQYHDHHKDR 1560 HQGDSYKKSD SRKRPYSSFS NGKDHRDWDH YKQDSRYYSD REKHRKLDDH RSRDHRSNLE 1620 GSLKDRSHSD HRSHSDHRLH SDHRSSSEYT HHKSSRDYRY HSDWQMDHRA SSSGPRSPLD 1680 QRSPYGSRSP FEHSVEHKST PEHTWSSRKT 1711 |
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Keyword | KW-0002--3D-structure |
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Interpro | IPR000953--Chromo/shadow_dom |
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PROSITE | PS00598--CHROMO_1 |
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Pfam | PF00385--Chromo |
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Gene Ontology | GO:0005737--C:cytoplasm |