dbPAF Protein Information
Tag | Content | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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dbPAF ID | dbPAF-0000451 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Uniprot Accession | O13527; YA11B_YEAST; D6VPM1; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genbank Protein ID | NP_009406.1; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genbank Nucleotide ID | NM_001178213.1; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | Truncated transposon Ty1-A Gag-Pol polyprotein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Synonyms/Alias | TY1B;Transposon Ty1 TYB polyprotein; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | TY1B-A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Synonyms/Alias | YARCTy1-1 POL;YAR009C; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism | Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)(Baker's yeast) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NCBI Taxa ID | 559292 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Functional Description (View all) |
Reverse transcriptase/ribonuclease H (RT) is a multifunctional enzyme that catalyzes the conversion of the retro-elements RNA genome into dsDNA within the VLP. The enzyme displays a DNA polymerase activity that can copy either DNA or RNA templates, and a ribonuclease H (RNase H) activity that cleaves the RNA strand of RNA-DNA heteroduplexes during plus-strand synthesis and hydrolyzes RNA primers. The conversion leads to a linear dsDNA copy of the retrotransposon that includes long terminal repeats (LTRs) at both ends (By similarity). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phosphorylation Sites |
dbPAF PTMs: 50 (View all)
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Sequence (Fasta) | METFTGYLKS TCFHQISPYP PSIMSIQVKV HANILILSFI ECLRMPMHRQ IRYSLKNNTI 60 TYFNESDVDW SSAIDYQCPD CLIGKSTKHR HIKGSRLKYQ NSYEPFQYLH TDIFGPVHNL 120 PKSAPSYFIS FTDETTKLRW VYPLHDRRED SILDVFTTIL AFIKNQFQAS VLVIQMDRGS 180 EYTNRTLHKF LEKNGITPCY TTTADSRAHG VAERLNRTLL DDCRTQLQCS GLPNHLWFSA 240 IEFSTIVRNS LASPKSKKSA RQHAGLAGLD ISTLLPFGQP VIVNDHNPNS KIHPRGIPGY 300 ALHPSRNSYG YIIYLPSLKK TVDTTNYVIL QGKESRLDQF NYDALTFDED LNRLTASYHS 360 FIASNEIQES NDLNIESDHD FQSDIELHPE QPRNVLSKAV SPTDSTPPST HTEDSKRVSK 420 TNIRAPREVD PNISESNILP SKKRSSTPQI SNIESTGSGG MHKLNVPLLA PMSQSNTHES 480 SHASKSKDFR HSDSYSENET NHTNVPISST GGTNNKTVPQ ISDQETEKRI IHRSPSIDAS 540 PPENNSSHNI VPIKTPTTVS EQNTEESIIA DLPLPDLPPE SPTEFPDPFK ELPPINSHQT 600 NSSLGGIGDS NAYTTINSKK RSLEDNETEI KVSRDTWNTK NMRSLEPPRS KKRIHLIAAV 660 KAVKSIKPIR TTLRYDEAIT YNKDIKEKEK YIEAYHKEVN QLLKMNTWDT DKYYDRKEID 720 PKRVINSMFI FNKKRDGTHK ARFVARGDIQ HPDTYDTGMQ SNTVHHYALM TSLSLALDNN 780 YYITQLDISS AYLYADIKEE LYIRPPPHLG MNDKLIRLKK SLYGLKQSGA NWYETIKSYL 840 IKQCGMEEVR GWSCVFKNSQ VTICLFVDDM ILFSKDLNAN KKIITTLKKQ YDTKIINLGE 900 SDNEIQYDIL GLEIKYQRGK YMKLGMEKSL TEKLPKLNVP LNPKGKKLRA PGQPGLYIDQ 960 DELEIDEDEY KEKVHEMQKL IGLASYVGYK FRFDLLYYIN TLAQHILFPS RQVLDMTYEL 1020 IQFMWDTRDK QLIWHKNKPT EPDNKLVAIS DASYGNQPYY KSQIGNIYLL NGKVIGGKST 1080 KASLTCTSTT EAEIHAISES VPLLNNLSYL IQELNKKPII KGLLTDSRST ISIIKSTNEE 1140 KFRNRFFGTK AMRLRDEVSG NNLYVYYIET KKNIADVMTK PLPIKTFKLL TNKWIH 1197 |
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Keyword | KW-0181--Complete proteome |
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Interpro | IPR001584--Integrase_cat-core |
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PROSITE | PS50994--INTEGRASE |
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Pfam | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | GO:0005737--C:cytoplasm |