dbPAF Protein Information
Tag | Content | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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dbPAF ID | dbPAF-0000105 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Uniprot Accession | O00472; ELL2_HUMAN; B4DNK7; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genbank Protein ID | NP_036213.2; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genbank Nucleotide ID | NM_012081.5; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | RNA polymerase II elongation factor ELL2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Synonyms/Alias | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | ELL2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Synonyms/Alias | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism | Homo sapiens(Human) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NCBI Taxa ID | 9606 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Functional Description (View all) |
Elongation factor component of the super elongation complex (SEC), a complex required to increase the catalytic rate of RNA polymerase II transcription by suppressing transient pausing by the polymerase at multiple sites along the DNA. Component of the little elongation complex (LEC), a complex required to regulate small nuclear RNA (snRNA) gene transcription by RNA polymerase II and III (PubMed:22195968). Plays a role in immunoglobulin secretion in plasma cells: directs efficient alternative mRNA processing, influencing both proximal poly(A) site choice and exon skipping, as well as immunoglobulin heavy chain (IgH) alternative processing. Probably acts by regulating histone modifications accompanying transition from membrane-specific to secretory IgH mRNA expression. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phosphorylation Sites |
dbPAF PTMs: 31 (View all)
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Sequence (Fasta) | MAAGGTGGLR EEQRYGLSCG RLGQDNITVL HVKLTETAIR ALETYQSHKN LIPFRPSIQF 60 QGLHGLVKIP KNDPLNEVHN FNFYLSNVGK DNPQGSFDCI QQTFSSSGAS QLNCLGFIQD 120 KITVCATNDS YQMTRERMTQ AEEESRNRST KVIKPGGPYV GKRVQIRKAP QAVSDTVPER 180 KRSTPMNPAN TIRKTHSSST ISQRPYRDRV IHLLALKAYK KPELLARLQK DGVNQKDKNS 240 LGAILQQVAN LNSKDLSYTL KDYVFKELQR DWPGYSEIDR RSLESVLSRK LNPSQNAAGT 300 SRSESPVCSS RDAVSSPQKR LLDSEFIDPL MNKKARISHL TNRVPPTLNG HLNPTSEKSA 360 AGLPLPPAAA AIPTPPPLPS TYLPISHPPQ IVNSNSNSPS TPEGRGTQDL PVDSFSQNDS 420 IYEDQQDKYT SRTSLETLPP GSVLLKCPKP MEENHSMSHK KSKKKSKKHK EKDQIKKHDI 480 ETIEEKEEDL KREEEIAKLN NSSPNSSGGV KEDCTASMEP SAIELPDYLI KYIAIVSYEQ 540 RQNYKDDFNA EYDEYRALHA RMETVARRFI KLDAQRKRLS PGSKEYQNVH EEVLQEYQKI 600 KQSSPNYHEE KYRCEYLHNK LAHIKRLIGE FDQQQAESWS 641 |
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Keyword | KW-0002--3D-structure |
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Interpro | IPR031176--ELL/occludin |
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PROSITE | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pfam | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | GO:0005813--C:centrosome |